● SiteSucker（シェアウェア）

https://ricks-apps.com/osx/sitesucker/index.html

保存したときにローカルにリンクを書き換えてくれるのでおすすめ。
オプションも豊富。
iPhone版SiteSuckerはこちら
http://itunes.apple.com/app/sitesucker/id346896838?mt=8

● WebArchive Folderizer

http://homepage.mac.com/gweston/download.html
Safari「WEbアーカイブ」保存したファイルをフォルダに切り分ける。便利

● PageSucker（シェアウェア）

http://www.pagesucker.com/